yarrg/canon

   1 #!/usr/bin/perl -w
   2 use strict qw(refs vars);
   3 our %s;
   4 foreach my $ab (qw(0 1)) {
   5     open F, "zcat $ARGV[$ab] |" or die $!;
   6     while (<F>) {
   7         my @l= split /\t/, $_;
   8         next unless length $l[2];
   9         $l[3]='1001' if $l[3] eq '>1000';
  10         my $k= sprintf "%-23s\t%-31s", $l[0], $l[1];
  11         $s{$k}[$ab*2]= $l[2];
  12         $s{$k}[$ab*2+1]= $l[3];
  13     }
  14     close F or die $!;
  15 }
  16 foreach my $k (sort keys %s) {
  17     my @r= @{ $s{$k} };
  18     my $whynot=
  19         !defined($r[0]) ? 'ADD' :
  20         !defined($r[2]) ? 'DEL' :
  21         $r[0] != $r[2] ? 'pri' :
  22         $r[1] != $r[3] ? (sprintf "qt %4d",($r[3]-$r[1])) :
  23         undef;
  24     next unless $whynot;
  25     print $whynot,"\t",$k;
  26     print "\t", defined($_) ? $_ : "-" foreach @r;
  27     print "\n";
  28 }