nice-64-125.history

   1    75  sed -n '/START,START/ s/.*qi//p' <good-t |sort |less
   2    76  sed -n '/START/,/START/ s/.*qi//p' <good-t |sort |less
   3    77  less good-t
   4    78  sed -n '/START/,/START/ s/.*qi//p' <good-t |sort |less
   5    79  sed -n '/START/,/START/ s/.*qi//p' <good-t |less
   6    80  sed -n '10,$ { / s/.*qi//p; /START/ q }' <good-t |less
   7    81  sed -n '10,$ { / s/.*qi//p; /START/{ q }; }' <good-t |less
   8    82  sed -n '10,$ { s/.*qi//p; /START/ q }' <good-t |less
   9    83  sed -n '10,$ { s/.*qi//p; /START/ q }' <good-t |less
  10    84  sed -n '10,$ { s/.*qi//p; /START/ q }' <good-t |sort |less
  11    85  sed -n '10,$ { s/.*qi//p; /START/ q }' <good-t |less
  12    86  less good-t
  13    87  sed -n '10,$ { s/.*qi//p; /START/ q }' <good-t |less
  14    88  less good-t
  15    89  less good-t
  16    90  rm *.o; make minimise-125 OPTIMISE=-pg NPROCCFLAGS=-DNPROCESSORS=1
  17    91  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.CFM -obest-125.CFM 2>t
  18    92  less good-t
  19    93  sed -n '10,$ { s/.*qi//p; /START/ q }' <good-t |less
  20    94  less good-t
  21    95  rm *.o; make minimise-125 OPTIMISE=-pg NPROCCFLAGS=-DNPROCESSORS=1
  22    96  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.CFM -obest-125.CFM 2>t
  23    97  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.CFM -obest-125.CFM 2>good-t
  24    98  less good-t
  25    99  sed -n '10,$ { s/.*qi//p; /START/ q }' <good-t |less
  26   100  less good-t
  27   101  sed -n 's/.*qi//p; 10,$ { /START/ q }' <good-t |less
  28   102  sed -n '/START/,/START/ { s/.*qi//p; b; } /START/q' <good-t |less
  29   103  sed -n '/START/,/START/ { s/.*qi//p; b; }; /START/q' <good-t |less
  30   104  sed -n '/START/,/START/ { s/.*qi//p; b; }; /START/q' <good-t |less
  31   105  sed -n '/START/,/START/ { s/.*qi//p; b; }; /START/q' <good-t |sort |less
  32   106  sed -n '/START/,/START/ { s/.*qi//p; b; }; /START/q' <good-t |less
  33   107  sed -n 's/.*qi//p; 10,$ { /START/ q }' <good-t |less
  34   108  sed -n 's/.*qi//p; 10,$ { /START/ q }' <good-t |less
  35   109  sed -n 's/.*qi//p; 10,$ { /START/ q }' <good-t |sort |less
  36   110  rm *.o; make minimise-125 OPTIMISE=-pg
  37   111  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.CFM -obest-125.CFM 2>t
  38   112  less t
  39   113  sed -n 's/.*qi//p; 10,$ { /START/ q }' <t |less
  40   114  less t
  41   115  diff -u <(sed -n 's/.*qi//p; 10,$ { /START/ q }' <good-t |sort) <(sed -n 's/.*qi//p; 10,$ { /START/ q }' <t) |less
  42   116  diff -u <(sed -n 's/.*qi//p; 10,$ { /START/ q }' <good-t |sort) <(sed -n 's/.*qi//p; 10,$ { /START/ q }' <t |sort) |less
  43   117  less t
  44   118  strace -ou ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.CFM -obest-125.CFM 2>t
  45   119  diff -u <(sed -n 's/.*qi//p; 10,$ { /START/ q }' <good-t |sort) <(sed -n 's/.*qi//p; 10,$ { /START/ q }' <t |sort) |less
  46   120  less t
  47   121  less u
  48   122  less u
  49   123  strace -fou ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.CFM -obest-125.CFM 2>t
  50   124  diff -u <(sed -n 's/.*qi//p; 10,$ { /START/ q }' <good-t |sort) <(sed -n 's/.*qi//p; 10,$ { /START/ q }' <t |sort) |less
  51   125  less t
  52   126  less u
  53   127  less t
  54   128  diff -u <(sed -n 's/.*qi//p; 10,$ { /START/ q }' <good-t |sort) <(sed -n 's/.*qi//p; 10,$ { /START/ q }' <t |sort) |less
  55   129  less t
  56   130  less t
  57   131  less u
  58   132  strace -s100 -fou ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.CFM -obest-125.CFM 2>t
  59   133  less t
  60   134  diff -u <(sed -n 's/.*qi//p; 10,$ { /START/ q }' <good-t |sort) <(sed -n 's/.*qi//p; 10,$ { /START/ q }' <t |sort) |less
  61   135  less t
  62   136  less t
  63   137  less u
  64   138  uname -av
  65   139  history >history
  66   140  ls
  67   141  cd etc/
  68   142  ls
  69   143  ls rc0.d
  70   144  ls rcS.d
  71   145  ls rcS.d/*nbd*
  72   146  emacs
  73   147  cd /usr/src/
  74   148  cat >gsl.runes
  75   149  ed gsl.runes
  76   150  ed gsl.runes
  77   151  cd things/moebius2/
  78   152  emcs
  79   153  emacs
  80   154  cd things/moebius2/
  81   155  cat history
  82   156  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.CFM -obest-125.CFM 2>t
  83   157  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.CFM -obest-125.CFM 2>>t
  84   158  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.CFM -obest-125.CFM 2>>t
  85   159  rm *.o; make minimise-125 OPTIMISE=-pg
  86   160  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.CFM -obest-125.CFM 2>>t
  87   161  less t
  88   162  diff -u <(sed -n 's/.*qi//p; 10,$ { /START/ q }' <good-t |sort) <(sed -n 's/.*qi//p; 20,$ { /START/ q }' <t |sort) |less
  89   163  rm *.o; make minimise-125 OPTIMISE=-pg
  90   164  rm *.o; make minimise-125 OPTIMISE=-pg
  91   165  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.CFM -obest-125.CFM >/dev/null
  92   166  bzr diff
  93   167  bzr diff
  94   168  rm *.o; make minimise-125 OPTIMISE=-pg
  95   169  rm *.o; make minimise-125 OPTIMISE=-pg
  96   170  bzr ci -m 'machinery for checking that our OUTER parallel iteration works - before we delete it'
  97   171  rm *.o; make minimise-125 OPTIMISE=-pg
  98   172  bzr diff
  99   173  bzr log |less
 100   174  bzr diff -r115 |less
 101   175  bzr diff -r115 |less
 102   176  bzr diff -r115 |less
 103   177  bzr diff -r115 |less
 104   178  bzr ci -m 'get rid of debugging for checking OUTER iteration; leave SIGINT handler and fix to OUTER'
 105   179  rm *.o; make minimise-125 OPTIMISE=-pg
 106   180  rm *.o; make minimise-125 OPTIMISE='-O2 -pg'
 107   181  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.CFM -obest-125.CFM
 108   182  bzr ci -m 'on SIGINT, do not exit 0'
 109   183  cp gmon.out gmon.out.save
 110   184  bzr status
 111   185  rm *.o; make minimise-125 OPTIMISE='-O2 -pg'
 112   186  rm *.o; make minimise-125 OPTIMISE='-O2 -pg'
 113   187  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.CFM -obest-125.CFM
 114   188  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.CFM -obest-125.CFM
 115   189  rm *.o; make minimise-125 OPTIMISE='-pg'
 116   190  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.CFM -obest-125.CFM
 117   191  rm minimise-125
 118   192  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.CFM -obest-125.CFM
 119   193  rm *.o; make minimise-125 OPTIMISE='-pg'
 120   194  LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/profile/usr/lib ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.CFM -obest-125.CFM
 121   195  LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/profile/usr/lib ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.CFM -obest-125.CFM
 122   196  LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/profile/usr/lib ldd ./minimise-125
 123   197  LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/profile/usr/lib ldd ./minimise-125
 124   198  LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/profile/usr/lib ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.CFM -obest-125.CFM
 125   199  rm *.o; make minimise-125 OPTIMISE='-pg'
 126   200  g++ -MMD -pg -g -Wall -Wwrite-strings -Wpointer-arith -Werror -Wshadow -Wno-shadow -Wno-error -o minimise-125 energy+125.o graph+125.o mgraph+125.o minimise+125.o half+125.o parallel.o common.o -lgsl -lgslcblas -lpthread
 127   201  g++ -MMD -pg -g -Wall -Wwrite-strings -Wpointer-arith -Werror -Wshadow -Wno-shadow -Wno-error -o minimise-125 energy+125.o graph+125.o mgraph+125.o minimise+125.o half+125.o parallel.o common.o /usr/src/profile/gsl-1.10/.libs/libgsl.a /usr/src/profile/gsl-1.10/cblas/.libs/libgslcblas.a -lpthread
 128   202  LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/profile/usr/lib ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.CFM -obest-125.CFM
 129   203  LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/profile/usr/lib ldd ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.CFM -obest-125.CFM
 130   204   ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.CFM -obest-125.CFM
 131   205  g++ -MMD -pg -g -Wall -Wwrite-strings -Wpointer-arith -Werror -Wshadow -Wno-shadow -Wno-error -o minimise-125 energy+125.o graph+125.o mgraph+125.o minimise+125.o half+125.o parallel.o common.o /usr/src/profile/gsl-1.10/.libs/libgsl.a /usr/src/profile/gsl-1.10/cblas/.libs/libgslcblas.a -lpthread
 132   206   ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.CFM -obest-125.CFM
 133   207  bzr diff
 134   208  bzr diff
 135   209  bzr diff
 136   210  rm *.o; make minimise-125 OPTIMISE='-pg'
 137   211  rm *.o; make minimise-125 OPTIMISE='-pg'
 138   212  g++ -MMD -pg -g -Wall -Wwrite-strings -Wpointer-arith -Werror -Wshadow -Wno-shadow -Wno-error -o minimise-125 energy+125.o graph+125.o mgraph+125.o minimise+125.o half+125.o parallel.o common.o /usr/src/profile/gsl-1.10/.libs/libgsl.a /usr/src/profile/gsl-1.10/cblas/.libs/libgslcblas.a -lpthread
 139   213   ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.CFM -obest-125.CFM
 140   214  rm *.o; make minimise-125 OPTIMISE='-pg'
 141   215  rm *.o; make minimise-125 OPTIMISE='-pg -O3'
 142   216  g++ -MMD -pg -g -Wall -Wwrite-strings -Wpointer-arith -Werror -Wshadow -Wno-shadow -Wno-error -o minimise-125 energy+125.o graph+125.o mgraph+125.o minimise+125.o half+125.o parallel.o common.o /usr/src/profile/gsl-1.10/.libs/libgsl.a /usr/src/profile/gsl-1.10/cblas/.libs/libgslcblas.a -lpthread
 143   217   ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.CFM -obest-125.CFM
 144   218  bzr status
 145   219  bzr diff energy.c
 146   220  bzr ci -m 'actually do precomputations!' energy.c
 147   221  less history
 148   222  history >history
 149   223  bzr diff Makefile
 150   224  bzr ci -m 'use -O3' Makefile
 151   225  grep main *.c
 152   226  rm *.o; make minimise-125 OPTIMISE='-pg -O3'
 153   227  rm *.o; make minimise-125 OPTIMISE='-pg -O3'
 154   228  g++ -MMD -pg -g -Wall -Wwrite-strings -Wpointer-arith -Werror -Wshadow -Wno-shadow -Wno-error -o minimise-125 energy+125.o graph+125.o mgraph+125.o minimise+125.o half+125.o parallel.o common.o /usr/src/profile/gsl-1.10/.libs/libgsl.a /usr/src/profile/gsl-1.10/cblas/.libs/libgslcblas.a -lpthread
 155   229   ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.CFM -obest-125.CFM
 156   230  bzr status
 157   231  bzr ci -m 'memoise edge_end2 now performance is good'
 158   232  cd /usr/local/profile/
 159   233  dpkg -x /usr/src/profile/libgsl0-dbg_1.10-4_i386.deb
 160   234  dpkg -x /usr/src/profile/libgsl0-dbg_1.10-4_i386.deb .
 161   235  ls -ald .
 162   236  really chown ian .
 163   237  dpkg -x /usr/src/profile/libgsl0-dbg_1.10-4_i386.deb .
 164   238  dpkg -x /usr/src/profile/libgsl0-dev_1.10-4_i386.deb .
 165   239  dpkg -x /usr/src/profile/libgsl0ldbl_1.10-4_i386.deb .
 166   240  ls usr/lib/
 167   241  file usr/lib/libgsl.so.0.10.0
 168   242  dpkg -x /usr/src/profile/libgsl0ldbl_1.10-4_i386.deb .
 169   243  dpkg -x /usr/src/profile/libgsl0-dev_1.10-4_i386.deb .
 170   244  dpkg -x /usr/src/profile/libgsl0-dbg_1.10-4_i386.deb .
 171   245  history
 172   246  pwd
 173   247  man gprof
 174   248  man 3 monitor
 175   249  man 3 profil
 176   250  info gcc
 177   251  man gcc
 178   252  man -k gcc
 179   253  cd /usr/src/gsl-1.10/
 180   254  ls
 181   255  cd ..
 182   256  ls
 183   257  mkdir profile
 184   258  cd profile/
 185   259  apt-get source gsl
 186   260  cd gsl-1.10/
 187   261  ls
 188   262  less debian/rules
 189   263  patch -p1 <../../gsl.patch
 190   264  DEBUGFLAGS='-g -O3 -pg' dpkg-buildpackage -us -uc -rfakeroot -b
 191   265  MAKEFLAGS=-j16 DEBUGFLAGS='-g -O3 -pg' dpkg-buildpackage -us -uc -rfakeroot -b
 192   266  MAKEFLAGS=-j16 DEBUGFLAGS='-g -O3 -pg' dpkg-buildpackage -us -uc -rfakeroot -b
 193   267  MAKEFLAGS=-j16 DEBUGFLAGS='-g -O3 -pg' dpkg-buildpackage -us -uc -rfakeroot -b
 194   268  less debian/rules
 195   269  cd ..
 196   270  rm -rf gsl-1.10
 197   271  apt-get source gsl
 198   272  cd gsl-1.10/
 199   273  patch -p1 <../../gsl.patch
 200   274  MAKE='make -j16' DEBUGFLAGS='-g -O3 -pg' dpkg-buildpackage -us -uc -rfakeroot -b
 201   275  debian/rules clean
 202   276  fakeroot debian/rules clean
 203   277  MAKE='make -j16' debian/rules build DEBUGFLAGS='-g -O3 -pg'
 204   278  fakeroot debian/rules binary DEBUGFLAGS='-g -O3 -pg'
 205   279  less debian/rules
 206   280  man dh_strip
 207   281  fakeroot debian/rules clean
 208   282  DEB_BUILD_OPTIONS=nostrip MAKE='make -j16' debian/rules build DEBUGFLAGS='-g -O3 -pg'
 209   283  DEB_BUILD_OPTIONS=nostrip MAKE='make -j16' fakeroot debian/rules binary DEBUGFLAGS='-g -O3 -pg'
 210   284  find -name '*.a'
 211   285  find -name 'libgsl.a'
 212   286  find -name '*blas*.a'
 213   287  history
 214   288  patch -p1 </usr/src/gsl.patch2
 215   289  fakeroot debian/rules clean
 216   290  MAKE='make -j16' debian/rules build DEBUGFLAGS='-g -O3 -pg'
 217   291  fakeroot debian/rules clean
 218   292  DEB_BUILD_OPTIONS=nostrip MAKE='make -j16' debian/rules build DEBUGFLAGS='-g -O3 -pg'
 219   293  fakeroot debian/rules clean
 220   294  DEB_BUILD_OPTIONS=nostrip MAKE='make -j16' debian/rules build DEBUGFLAGS='-g -O3 -pg'
 221   295  DEB_BUILD_OPTIONS=nostrip MAKE='make -j16' fakeroot debian/rules binary DEBUGFLAGS='-g -O3 -pg'
 222   296  cd /usr/src/
 223   297  mkdir orig
 224   298  cd orig
 225   299  apt-get source gsl
 226   300  cd ..
 227   301  diff -ru {orig/,}gsl-1.10 |less
 228   302  diff -ru {orig/,}gsl-1.10/multimin |less
 229   303  mkdir orig2
 230   304  rsync -a --delete orig/gsl-1.10 orig2/.
 231   305  cd orig2/gsl-1.10/
 232   306  patch -p1 <../../gsl.patch
 233   307  cd ../..
 234   308  diff -ru {orig2/,}gsl-1.10/multimin |less
 235   309  diff -ru {orig2/,}gsl-1.10/multimin >gsl.patch2
 236   310  diff -ru {orig2/,}gsl-1.10/multimin >gsl.patch2
 237   311  diff -ru {orig2/,}gsl-1.10/multimin >gsl.patch2
 238   312  diff -ru {orig2/,}gsl-1.10/multimin >gsl.patch2
 239   313  diff -ru {orig2/,}gsl-1.10/multimin >gsl.patch2
 240   314  diff -ru {orig2/,}gsl-1.10/multimin >gsl.patch2
 241   315  diff -ru {orig2/,}gsl-1.10/multimin >gsl.patch2
 242   316  diff --exclude=\*{.orig,.rej,~} -ru {orig2/,}gsl-1.10/multimin >gsl.patch2
 243   317  echo diff --exclude=\*{.orig,.rej,~} -ru {orig2/,}gsl-1.10/multimin
 244   318  diff --exclude=\*{.orig,.rej,~} -ru {orig2/,}gsl-1.10/multimin >gsl.patch2
 245   319  diff --exclude=\*{.orig,.rej,~} -ru {orig2/,}gsl-1.10/multimin >gsl.patch2
 246   320  diff --exclude=\*{.orig,.rej,~} -ru {orig2/,}gsl-1.10/multimin >gsl.patch2
 247   321  cd things/moebius2/
 248   322  gprof minimise-125 |less
 249   323  gprof minimise-125 |less
 250   324  gprof minimise-125 |less
 251   325  gprof minimise-125 |less
 252   326  gprof minimise-125 |less
 253   327  gprof minimise-125 |less
 254   328  gprof minimise-125 |less
 255   329  gprof minimise-125 |less
 256   330  gprof minimise-125 |less
 257   331  gprof minimise-125 |less
 258   332  gprof minimise-125 |less
 259   333  gprof minimise-125 |less
 260   334  gprof minimise-125 |less
 261   335  gprof minimise-125 |less
 262   336  gprof minimise-125 |less
 263   337  gprof minimise-125 |less
 264   338  cd things/moebius2/
 265   339  grep graph_layout_prepare *.c
 266   340  cd /usr/src/gsl-1.10/
 267   341  dpkg -l '*gsl*'
 268   342  find -name '*prof*'
 269   343  cd
 270   344  cd -
 271   345  ls
 272   346  less debian/rules
 273   347  grep -R profil *
 274   348  fakeroot debian/rules clean
 275   349  DEB_BUILD_OPTIONS=nostrip MAKE='make -j16' debian/rules build
 276   350  DEB_BUILD_OPTIONS=nostrip MAKE='make -j16' fakeroot debian/rules binary
 277   351  patch -p1 <../gsl.patch2
 278   352  patch -p1 <../gsl.patch2
 279   353  mv multimin/simplex.c.orig  multimin/simplex.c
 280   354  patch -U -p1 <../gsl.patch2
 281   355  mkdir ~/junk
 282   356  mkdir ~/junk/d
 283   357  mv multimin/simplex.c.orig  multimin/simplex.c
 284   358  diff -u ~/junk/d/simplex.c multimin/simplex.c |less
 285   359  patch -U -p1 <../gsl.patch2
 286   360  mv multimin/simplex.c.orig  multimin/simplex.c
 287   361  patch -U -p1 <../gsl.patch2
 288   362  less ../gsl.patch2
 289   363  mv multimin/simplex.c.orig  multimin/simplex.c
 290   364  patch -U -p1 <../gsl.patch2
 291   365  mv multimin/simplex.c.orig  multimin/simplex.c
 292   366  patch -U -p1 <../gsl.patch2
 293   367  diff -u ~/junk/d/simplex.c multimin/simplex.c |less
 294   368  mv multimin/simplex.c.orig  multimin/simplex.c
 295   369  diff -u ~/junk/d/simplex.c multimin/simplex.c |less
 296   370  patch -U -p1 <../gsl.patch2
 297   371  diff -u ~/junk/d/simplex.c multimin/simplex.c.orig |less
 298   372  diff -u ~/junk/d/simplex.c multimin/simplex.c.orig |less
 299   373  history
 300   374  fakeroot debian/rules clean
 301   375  DEB_BUILD_OPTIONS=nostrip MAKE='make -j16' debian/rules build
 302   376  fakeroot debian/rules clean
 303   377  DEB_BUILD_OPTIONS=nostrip MAKE='make -j16' debian/rules build
 304   378  DEB_BUILD_OPTIONS=nostrip MAKE='make -j16' fakeroot debian/rules binary
 305   379  cd things/moebius2/
 306   380  grep graph_layout_prepare *.c
 307   381  less things/moebius2/Makefile
 308   382  emacs things/moebius2/energy.c
 309   383  cd things/moebius2/
 310   384  rm *.o; make minimise-125
 311   385  ./interpolate-246 -aa start-125.cfm -ostart-246.cfm
 312   386  make interpolate-246
 313   387  ./interpolate-246 -aa start-125.cfm -ostart-246.cfm
 314   388  make minimise-246
 315   389  make minimise-246
 316   390  ./interpolate-246 -aa start-125.cfm -ostart-246.cfm
 317   391   ./minimise-246 start-246.cfm -iwip-246.CFM -obest-246.CFM
 318   392  bzr diff
 319   393  bzr ci -m 'allow compiling spuriously with XBITS>=6'
 320   394  make
 321   395  make
 322   396  make -j8
 323   397  bzr diff
 324   398  bzr ci -m 'primer does not need mgraph_prepare'
 325   399   ./minimise-246 start-246.cfm -iwip-246.CFM -obest-246.CFM
 326   400   ./minimise-246 start-246.cfm -iwip-246.CFM -obest-246.CFM
 327   401   ./minimise-246 start-246.cfm -iwip-246.CFM -obest-246.CFM
 328   402   ./minimise-246 start-246.cfm -iwip-246.CFM -obest-246.CFM
 329   403  top
 330   404  cd things/moebius2
 331   405  bzr status
 332   406  ls
 333   407  make compute
 334   408  make clean
 335   409  make -j4
 336   410  make compute
 337   411  pwd
 338   412  make compute
 339   413  rm best-33.CFM
 340   414  make compute
 341   415  make -n compute
 342   416  make -n best-968.CFM
 343   417  make -n best-33.CFM
 344   418  make best-33.CFM
 345   419  make best-64.CFM
 346   420  make best-64.cfm
 347   421  ./interpolate-64 -aa best-33.CFM -ostart-64.cfm
 348   422  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.CFM -obest-64.CFM
 349   423  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 350   424  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 351   425  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 352   426  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 353   427  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 354   428  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 355   429  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 356   430  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 357   431  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 358   432  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 359   433  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 360   434  history >nice-64.history
 361   435  fg
 362   436  fg
 363   437  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 364   438  bzr status
 365   439  history >nice-64.history
 366   440  bzr ci -m 'stopping point for 64'
 367   441  bzr status
 368   442  bzr status
 369   443  cd things/moebius2
 370   444  bzr status
 371   445  bzr diff
 372   446  bzr ci -m 'adjusted costs for 64'
 373   447  top
 374   448  top
 375   449  top
 376   450  cd things/moebius2/
 377   451  ./interpolate-125 -aa best-64.CFM -ostart-1256.cfm
 378   452  ./interpolate-125 -aa best-64.CFM -ostart-125.cfm
 379   453  rm ./start-1256.cfm
 380   454  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 381   455  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 382   456  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 383   457  cp start-125.cfm wip-125.cfm
 384   458  cp start-125.cfm wip-125.cfm
 385   459  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 386   460  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 387   461  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 388   462  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 389   463  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 390   464  ls -al minimise-125
 391   465  date
 392   466  lsss energy.c
 393   467  less energy.c
 394   468  make minimise-125
 395   469  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 396   470  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 397   471  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 398   472  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 399   473  ls
 400   474  ls *hist8
 401   475  ls *hist*
 402   476  history >wip-125.history
 403   477  bzr status
 404   478  bzr diff |les
 405   479  bzr diff |less
 406   480  bzr ci -m 'attempts to fix 125; really need to combine edge length variation and bending costs'
 407   481  bzr update
 408   482  ls ../
 409   483  bzr pull ../moebius2-from-liberator
 410   484  bzr merge ../moebius2-from-liberator
 411   485  bzr status
 412   486  bzr diff
 413   487  bzr ci -m merge
 414   488  bzr push
 415   489  bzr pull ../moebius2-from-liberator
 416   490  bzr merge ../moebius2-from-liberator
 417   491  bzr status
 418   492  bzr ci -m merge
 419   493  bzr status
 420   494  bzr pull ../moebius2-from-liberator
 421   495  cd things/moebius2
 422   496  pwd
 423   497  bzr pull ../moebius2-from-liberator
 424   498  cat new-costs.history
 425   499  cp start-64.cfm wip-64.cfm
 426   500  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 427   501  cp wip-64.cfm best-64.CFM
 428   502  ./interpolate-125 -aa best-64.CFM -ostart-125.cfm
 429   503  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 430   504  cp start-125.cfm wip-125.cfm
 431   505  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 432   506  ./minimise-125 wip-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 433   507  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 434   508  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 435   509  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 436   510  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 437   511  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 438   512  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 439   513  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 440   514  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 441   515  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 442   516  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 443   517  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 444   518  ./interpolate-125 -aa best-64.CFM -ostart-125.cfm
 445   519  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 446   520  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 447   521  ./interpolate-125 -aa wip-64.cfm -ostart-125.cfm
 448   522  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 449   523  bzr status
 450   524  bzr diff
 451   525  bzr diff Makefile
 452   526  bzr ci -m 'build more stuff' Makefile
 453   527  bzr stauts
 454   528  bzr status
 455   529  bzr ci -m 'wip energy functions'
 456   530  bzr pull ../moebius2-from-liberator/
 457   531  bzr status
 458   532  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 459   533  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 460   534  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 461   535  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 462   536  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 463   537  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 464   538  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 465   539  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 466   540  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM 2>&1 |less
 467   541  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM 2>&1 |less
 468   542  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM 2>&1 |less
 469   543  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 470   544  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 471   545  bzr ci -m 'before abandon this version of rim twist which is nonsense'
 472   546  bzr ci -m 'before abandon this version of rim twist which is nonsense'
 473   547  bzr uncommit
 474   548  bzr status
 475   549  bzr log |less
 476   550  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 477   551  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 478   552  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 479   553  ./interpolate-125 -aa best-64.CFM -ostart-125.cfm
 480   554  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 481   555  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 482   556  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 483   557  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 484   558  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 485   559  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 486   560  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 487   561  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 488   562  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 489   563  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 490   564  bzr status
 491   565  bzr ci -m 'wip before increase power of bendings'
 492   566  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 493   567  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 494   568  bzr status
 495   569  bzr diff
 496   570  bzr ci -m 'changed powers on vertex displacements  -- tweaked parameters for XBITS==5'
 497   571  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 498   572  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 499   573  bzr status
 500   574  history >nice-64.history
 501     6  less good-t
 502     7  rm *.o; make minimise-125 OPTIMISE=-pg NPROCCFLAGS=-DNPROCESSORS=1
 503     8  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.CFM -obest-125.CFM 2>t
 504     9  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.CFM -obest-125.CFM 2>good-t
 505    10  less good-t
 506    11  sed -n '10,$ { s/.*qi//p; /START/ q }' <good-t |less
 507    12  less good-t
 508    13  sed -n 's/.*qi//p; 10,$ { /START/ q }' <good-t |less
 509    14  sed -n '/START/,/START/ { s/.*qi//p; b; } /START/q' <good-t |less
 510    15  sed -n '/START/,/START/ { s/.*qi//p; b; }; /START/q' <good-t |less
 511    16  sed -n '/START/,/START/ { s/.*qi//p; b; }; /START/q' <good-t |less
 512    17  sed -n '/START/,/START/ { s/.*qi//p; b; }; /START/q' <good-t |sort |less
 513    18  sed -n '/START/,/START/ { s/.*qi//p; b; }; /START/q' <good-t |less
 514    19  sed -n 's/.*qi//p; 10,$ { /START/ q }' <good-t |less
 515    20  sed -n 's/.*qi//p; 10,$ { /START/ q }' <good-t |less
 516    21  sed -n 's/.*qi//p; 10,$ { /START/ q }' <good-t |sort |less
 517    22  rm *.o; make minimise-125 OPTIMISE=-pg
 518    23  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.CFM -obest-125.CFM 2>t
 519    24  less t
 520    25  sed -n 's/.*qi//p; 10,$ { /START/ q }' <t |less
 521    26  less t
 522    27  diff -u <(sed -n 's/.*qi//p; 10,$ { /START/ q }' <good-t |sort) <(sed -n 's/.*qi//p; 10,$ { /START/ q }' <t) |less
 523    28  diff -u <(sed -n 's/.*qi//p; 10,$ { /START/ q }' <good-t |sort) <(sed -n 's/.*qi//p; 10,$ { /START/ q }' <t |sort) |less
 524    29  less t
 525    30  strace -ou ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.CFM -obest-125.CFM 2>t
 526    31  diff -u <(sed -n 's/.*qi//p; 10,$ { /START/ q }' <good-t |sort) <(sed -n 's/.*qi//p; 10,$ { /START/ q }' <t |sort) |less
 527    32  less t
 528    33  less u
 529    34  less u
 530    35  strace -fou ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.CFM -obest-125.CFM 2>t
 531    36  diff -u <(sed -n 's/.*qi//p; 10,$ { /START/ q }' <good-t |sort) <(sed -n 's/.*qi//p; 10,$ { /START/ q }' <t |sort) |less
 532    37  less t
 533    38  less u
 534    39  less t
 535    40  diff -u <(sed -n 's/.*qi//p; 10,$ { /START/ q }' <good-t |sort) <(sed -n 's/.*qi//p; 10,$ { /START/ q }' <t |sort) |less
 536    41  less t
 537    42  less t
 538    43  less u
 539    44  strace -s100 -fou ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.CFM -obest-125.CFM 2>t
 540    45  less t
 541    46  diff -u <(sed -n 's/.*qi//p; 10,$ { /START/ q }' <good-t |sort) <(sed -n 's/.*qi//p; 10,$ { /START/ q }' <t |sort) |less
 542    47  less t
 543    48  less t
 544    49  less u
 545    50  uname -av
 546    51  history >history
 547    52  ls
 548    53  cd etc/
 549    54  ls
 550    55  ls rc0.d
 551    56  ls rcS.d
 552    57  ls rcS.d/*nbd*
 553    58  emacs
 554    59  cd /usr/src/
 555    60  cat >gsl.runes
 556    61  ed gsl.runes
 557    62  ed gsl.runes
 558    63  cd things/moebius2/
 559    64  emcs
 560    65  emacs
 561    66  cd things/moebius2/
 562    67  cat history
 563    68  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.CFM -obest-125.CFM 2>t
 564    69  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.CFM -obest-125.CFM 2>>t
 565    70  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.CFM -obest-125.CFM 2>>t
 566    71  rm *.o; make minimise-125 OPTIMISE=-pg
 567    72  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.CFM -obest-125.CFM 2>>t
 568    73  less t
 569    74  diff -u <(sed -n 's/.*qi//p; 10,$ { /START/ q }' <good-t |sort) <(sed -n 's/.*qi//p; 20,$ { /START/ q }' <t |sort) |less
 570    75  rm *.o; make minimise-125 OPTIMISE=-pg
 571    76  rm *.o; make minimise-125 OPTIMISE=-pg
 572    77  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.CFM -obest-125.CFM >/dev/null
 573    78  bzr diff
 574    79  bzr diff
 575    80  rm *.o; make minimise-125 OPTIMISE=-pg
 576    81  rm *.o; make minimise-125 OPTIMISE=-pg
 577    82  bzr ci -m 'machinery for checking that our OUTER parallel iteration works - before we delete it'
 578    83  rm *.o; make minimise-125 OPTIMISE=-pg
 579    84  bzr diff
 580    85  bzr log |less
 581    86  bzr diff -r115 |less
 582    87  bzr diff -r115 |less
 583    88  bzr diff -r115 |less
 584    89  bzr diff -r115 |less
 585    90  bzr ci -m 'get rid of debugging for checking OUTER iteration; leave SIGINT handler and fix to OUTER'
 586    91  rm *.o; make minimise-125 OPTIMISE=-pg
 587    92  rm *.o; make minimise-125 OPTIMISE='-O2 -pg'
 588    93  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.CFM -obest-125.CFM
 589    94  bzr ci -m 'on SIGINT, do not exit 0'
 590    95  cp gmon.out gmon.out.save
 591    96  bzr status
 592    97  rm *.o; make minimise-125 OPTIMISE='-O2 -pg'
 593    98  rm *.o; make minimise-125 OPTIMISE='-O2 -pg'
 594    99  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.CFM -obest-125.CFM
 595   100  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.CFM -obest-125.CFM
 596   101  rm *.o; make minimise-125 OPTIMISE='-pg'
 597   102  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.CFM -obest-125.CFM
 598   103  rm minimise-125
 599   104  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.CFM -obest-125.CFM
 600   105  rm *.o; make minimise-125 OPTIMISE='-pg'
 601   106  LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/profile/usr/lib ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.CFM -obest-125.CFM
 602   107  LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/profile/usr/lib ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.CFM -obest-125.CFM
 603   108  LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/profile/usr/lib ldd ./minimise-125
 604   109  LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/profile/usr/lib ldd ./minimise-125
 605   110  LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/profile/usr/lib ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.CFM -obest-125.CFM
 606   111  rm *.o; make minimise-125 OPTIMISE='-pg'
 607   112  g++ -MMD -pg -g -Wall -Wwrite-strings -Wpointer-arith -Werror -Wshadow -Wno-shadow -Wno-error -o minimise-125 energy+125.o graph+125.o mgraph+125.o minimise+125.o half+125.o parallel.o common.o -lgsl -lgslcblas -lpthread
 608   113  g++ -MMD -pg -g -Wall -Wwrite-strings -Wpointer-arith -Werror -Wshadow -Wno-shadow -Wno-error -o minimise-125 energy+125.o graph+125.o mgraph+125.o minimise+125.o half+125.o parallel.o common.o /usr/src/profile/gsl-1.10/.libs/libgsl.a /usr/src/profile/gsl-1.10/cblas/.libs/libgslcblas.a -lpthread
 609   114  LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/profile/usr/lib ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.CFM -obest-125.CFM
 610   115  LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/profile/usr/lib ldd ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.CFM -obest-125.CFM
 611   116   ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.CFM -obest-125.CFM
 612   117  g++ -MMD -pg -g -Wall -Wwrite-strings -Wpointer-arith -Werror -Wshadow -Wno-shadow -Wno-error -o minimise-125 energy+125.o graph+125.o mgraph+125.o minimise+125.o half+125.o parallel.o common.o /usr/src/profile/gsl-1.10/.libs/libgsl.a /usr/src/profile/gsl-1.10/cblas/.libs/libgslcblas.a -lpthread
 613   118   ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.CFM -obest-125.CFM
 614   119  bzr diff
 615   120  bzr diff
 616   121  bzr diff
 617   122  rm *.o; make minimise-125 OPTIMISE='-pg'
 618   123  rm *.o; make minimise-125 OPTIMISE='-pg'
 619   124  g++ -MMD -pg -g -Wall -Wwrite-strings -Wpointer-arith -Werror -Wshadow -Wno-shadow -Wno-error -o minimise-125 energy+125.o graph+125.o mgraph+125.o minimise+125.o half+125.o parallel.o common.o /usr/src/profile/gsl-1.10/.libs/libgsl.a /usr/src/profile/gsl-1.10/cblas/.libs/libgslcblas.a -lpthread
 620   125   ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.CFM -obest-125.CFM
 621   126  rm *.o; make minimise-125 OPTIMISE='-pg'
 622   127  rm *.o; make minimise-125 OPTIMISE='-pg -O3'
 623   128  g++ -MMD -pg -g -Wall -Wwrite-strings -Wpointer-arith -Werror -Wshadow -Wno-shadow -Wno-error -o minimise-125 energy+125.o graph+125.o mgraph+125.o minimise+125.o half+125.o parallel.o common.o /usr/src/profile/gsl-1.10/.libs/libgsl.a /usr/src/profile/gsl-1.10/cblas/.libs/libgslcblas.a -lpthread
 624   129   ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.CFM -obest-125.CFM
 625   130  bzr status
 626   131  bzr diff energy.c
 627   132  bzr ci -m 'actually do precomputations!' energy.c
 628   133  less history
 629   134  history >history
 630   135  bzr diff Makefile
 631   136  bzr ci -m 'use -O3' Makefile
 632   137  grep main *.c
 633   138  rm *.o; make minimise-125 OPTIMISE='-pg -O3'
 634   139  rm *.o; make minimise-125 OPTIMISE='-pg -O3'
 635   140  g++ -MMD -pg -g -Wall -Wwrite-strings -Wpointer-arith -Werror -Wshadow -Wno-shadow -Wno-error -o minimise-125 energy+125.o graph+125.o mgraph+125.o minimise+125.o half+125.o parallel.o common.o /usr/src/profile/gsl-1.10/.libs/libgsl.a /usr/src/profile/gsl-1.10/cblas/.libs/libgslcblas.a -lpthread
 636   141   ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.CFM -obest-125.CFM
 637   142  bzr status
 638   143  bzr ci -m 'memoise edge_end2 now performance is good'
 639   144  cd /usr/local/profile/
 640   145  dpkg -x /usr/src/profile/libgsl0-dbg_1.10-4_i386.deb
 641   146  dpkg -x /usr/src/profile/libgsl0-dbg_1.10-4_i386.deb .
 642   147  ls -ald .
 643   148  really chown ian .
 644   149  dpkg -x /usr/src/profile/libgsl0-dbg_1.10-4_i386.deb .
 645   150  dpkg -x /usr/src/profile/libgsl0-dev_1.10-4_i386.deb .
 646   151  dpkg -x /usr/src/profile/libgsl0ldbl_1.10-4_i386.deb .
 647   152  ls usr/lib/
 648   153  file usr/lib/libgsl.so.0.10.0
 649   154  dpkg -x /usr/src/profile/libgsl0ldbl_1.10-4_i386.deb .
 650   155  dpkg -x /usr/src/profile/libgsl0-dev_1.10-4_i386.deb .
 651   156  dpkg -x /usr/src/profile/libgsl0-dbg_1.10-4_i386.deb .
 652   157  history
 653   158  pwd
 654   159  man gprof
 655   160  man 3 monitor
 656   161  man 3 profil
 657   162  info gcc
 658   163  man gcc
 659   164  man -k gcc
 660   165  cd /usr/src/gsl-1.10/
 661   166  ls
 662   167  cd ..
 663   168  ls
 664   169  mkdir profile
 665   170  cd profile/
 666   171  apt-get source gsl
 667   172  cd gsl-1.10/
 668   173  ls
 669   174  less debian/rules
 670   175  patch -p1 <../../gsl.patch
 671   176  DEBUGFLAGS='-g -O3 -pg' dpkg-buildpackage -us -uc -rfakeroot -b
 672   177  MAKEFLAGS=-j16 DEBUGFLAGS='-g -O3 -pg' dpkg-buildpackage -us -uc -rfakeroot -b
 673   178  MAKEFLAGS=-j16 DEBUGFLAGS='-g -O3 -pg' dpkg-buildpackage -us -uc -rfakeroot -b
 674   179  MAKEFLAGS=-j16 DEBUGFLAGS='-g -O3 -pg' dpkg-buildpackage -us -uc -rfakeroot -b
 675   180  less debian/rules
 676   181  cd ..
 677   182  rm -rf gsl-1.10
 678   183  apt-get source gsl
 679   184  cd gsl-1.10/
 680   185  patch -p1 <../../gsl.patch
 681   186  MAKE='make -j16' DEBUGFLAGS='-g -O3 -pg' dpkg-buildpackage -us -uc -rfakeroot -b
 682   187  debian/rules clean
 683   188  fakeroot debian/rules clean
 684   189  MAKE='make -j16' debian/rules build DEBUGFLAGS='-g -O3 -pg'
 685   190  fakeroot debian/rules binary DEBUGFLAGS='-g -O3 -pg'
 686   191  less debian/rules
 687   192  man dh_strip
 688   193  fakeroot debian/rules clean
 689   194  DEB_BUILD_OPTIONS=nostrip MAKE='make -j16' debian/rules build DEBUGFLAGS='-g -O3 -pg'
 690   195  DEB_BUILD_OPTIONS=nostrip MAKE='make -j16' fakeroot debian/rules binary DEBUGFLAGS='-g -O3 -pg'
 691   196  find -name '*.a'
 692   197  find -name 'libgsl.a'
 693   198  find -name '*blas*.a'
 694   199  history
 695   200  patch -p1 </usr/src/gsl.patch2
 696   201  fakeroot debian/rules clean
 697   202  MAKE='make -j16' debian/rules build DEBUGFLAGS='-g -O3 -pg'
 698   203  fakeroot debian/rules clean
 699   204  DEB_BUILD_OPTIONS=nostrip MAKE='make -j16' debian/rules build DEBUGFLAGS='-g -O3 -pg'
 700   205  fakeroot debian/rules clean
 701   206  DEB_BUILD_OPTIONS=nostrip MAKE='make -j16' debian/rules build DEBUGFLAGS='-g -O3 -pg'
 702   207  DEB_BUILD_OPTIONS=nostrip MAKE='make -j16' fakeroot debian/rules binary DEBUGFLAGS='-g -O3 -pg'
 703   208  cd /usr/src/
 704   209  mkdir orig
 705   210  cd orig
 706   211  apt-get source gsl
 707   212  cd ..
 708   213  diff -ru {orig/,}gsl-1.10 |less
 709   214  diff -ru {orig/,}gsl-1.10/multimin |less
 710   215  mkdir orig2
 711   216  rsync -a --delete orig/gsl-1.10 orig2/.
 712   217  cd orig2/gsl-1.10/
 713   218  patch -p1 <../../gsl.patch
 714   219  cd ../..
 715   220  diff -ru {orig2/,}gsl-1.10/multimin |less
 716   221  diff -ru {orig2/,}gsl-1.10/multimin >gsl.patch2
 717   222  diff -ru {orig2/,}gsl-1.10/multimin >gsl.patch2
 718   223  diff -ru {orig2/,}gsl-1.10/multimin >gsl.patch2
 719   224  diff -ru {orig2/,}gsl-1.10/multimin >gsl.patch2
 720   225  diff -ru {orig2/,}gsl-1.10/multimin >gsl.patch2
 721   226  diff -ru {orig2/,}gsl-1.10/multimin >gsl.patch2
 722   227  diff -ru {orig2/,}gsl-1.10/multimin >gsl.patch2
 723   228  diff --exclude=\*{.orig,.rej,~} -ru {orig2/,}gsl-1.10/multimin >gsl.patch2
 724   229  echo diff --exclude=\*{.orig,.rej,~} -ru {orig2/,}gsl-1.10/multimin
 725   230  diff --exclude=\*{.orig,.rej,~} -ru {orig2/,}gsl-1.10/multimin >gsl.patch2
 726   231  diff --exclude=\*{.orig,.rej,~} -ru {orig2/,}gsl-1.10/multimin >gsl.patch2
 727   232  diff --exclude=\*{.orig,.rej,~} -ru {orig2/,}gsl-1.10/multimin >gsl.patch2
 728   233  cd things/moebius2/
 729   234  gprof minimise-125 |less
 730   235  gprof minimise-125 |less
 731   236  gprof minimise-125 |less
 732   237  gprof minimise-125 |less
 733   238  gprof minimise-125 |less
 734   239  gprof minimise-125 |less
 735   240  gprof minimise-125 |less
 736   241  gprof minimise-125 |less
 737   242  gprof minimise-125 |less
 738   243  gprof minimise-125 |less
 739   244  gprof minimise-125 |less
 740   245  gprof minimise-125 |less
 741   246  gprof minimise-125 |less
 742   247  gprof minimise-125 |less
 743   248  gprof minimise-125 |less
 744   249  gprof minimise-125 |less
 745   250  cd things/moebius2/
 746   251  grep graph_layout_prepare *.c
 747   252  cd /usr/src/gsl-1.10/
 748   253  dpkg -l '*gsl*'
 749   254  find -name '*prof*'
 750   255  cd
 751   256  cd -
 752   257  ls
 753   258  less debian/rules
 754   259  grep -R profil *
 755   260  fakeroot debian/rules clean
 756   261  DEB_BUILD_OPTIONS=nostrip MAKE='make -j16' debian/rules build
 757   262  DEB_BUILD_OPTIONS=nostrip MAKE='make -j16' fakeroot debian/rules binary
 758   263  patch -p1 <../gsl.patch2
 759   264  patch -p1 <../gsl.patch2
 760   265  mv multimin/simplex.c.orig  multimin/simplex.c
 761   266  patch -U -p1 <../gsl.patch2
 762   267  mkdir ~/junk
 763   268  mkdir ~/junk/d
 764   269  mv multimin/simplex.c.orig  multimin/simplex.c
 765   270  diff -u ~/junk/d/simplex.c multimin/simplex.c |less
 766   271  patch -U -p1 <../gsl.patch2
 767   272  mv multimin/simplex.c.orig  multimin/simplex.c
 768   273  patch -U -p1 <../gsl.patch2
 769   274  less ../gsl.patch2
 770   275  mv multimin/simplex.c.orig  multimin/simplex.c
 771   276  patch -U -p1 <../gsl.patch2
 772   277  mv multimin/simplex.c.orig  multimin/simplex.c
 773   278  patch -U -p1 <../gsl.patch2
 774   279  diff -u ~/junk/d/simplex.c multimin/simplex.c |less
 775   280  mv multimin/simplex.c.orig  multimin/simplex.c
 776   281  diff -u ~/junk/d/simplex.c multimin/simplex.c |less
 777   282  patch -U -p1 <../gsl.patch2
 778   283  diff -u ~/junk/d/simplex.c multimin/simplex.c.orig |less
 779   284  diff -u ~/junk/d/simplex.c multimin/simplex.c.orig |less
 780   285  history
 781   286  fakeroot debian/rules clean
 782   287  DEB_BUILD_OPTIONS=nostrip MAKE='make -j16' debian/rules build
 783   288  fakeroot debian/rules clean
 784   289  DEB_BUILD_OPTIONS=nostrip MAKE='make -j16' debian/rules build
 785   290  DEB_BUILD_OPTIONS=nostrip MAKE='make -j16' fakeroot debian/rules binary
 786   291  cd things/moebius2/
 787   292  grep graph_layout_prepare *.c
 788   293  less things/moebius2/Makefile
 789   294  emacs things/moebius2/energy.c
 790   295  cd things/moebius2/
 791   296  rm *.o; make minimise-125
 792   297  ./interpolate-246 -aa start-125.cfm -ostart-246.cfm
 793   298  make interpolate-246
 794   299  ./interpolate-246 -aa start-125.cfm -ostart-246.cfm
 795   300  make minimise-246
 796   301  make minimise-246
 797   302  ./interpolate-246 -aa start-125.cfm -ostart-246.cfm
 798   303   ./minimise-246 start-246.cfm -iwip-246.CFM -obest-246.CFM
 799   304  bzr diff
 800   305  bzr ci -m 'allow compiling spuriously with XBITS>=6'
 801   306  make
 802   307  make
 803   308  make -j8
 804   309  bzr diff
 805   310  bzr ci -m 'primer does not need mgraph_prepare'
 806   311   ./minimise-246 start-246.cfm -iwip-246.CFM -obest-246.CFM
 807   312   ./minimise-246 start-246.cfm -iwip-246.CFM -obest-246.CFM
 808   313   ./minimise-246 start-246.cfm -iwip-246.CFM -obest-246.CFM
 809   314   ./minimise-246 start-246.cfm -iwip-246.CFM -obest-246.CFM
 810   315  top
 811   316  cd things/moebius2
 812   317  bzr status
 813   318  ls
 814   319  make compute
 815   320  make clean
 816   321  make -j4
 817   322  make compute
 818   323  pwd
 819   324  make compute
 820   325  rm best-33.CFM
 821   326  make compute
 822   327  make -n compute
 823   328  make -n best-968.CFM
 824   329  make -n best-33.CFM
 825   330  make best-33.CFM
 826   331  make best-64.CFM
 827   332  make best-64.cfm
 828   333  ./interpolate-64 -aa best-33.CFM -ostart-64.cfm
 829   334  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.CFM -obest-64.CFM
 830   335  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 831   336  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 832   337  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 833   338  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 834   339  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 835   340  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 836   341  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 837   342  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 838   343  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 839   344  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 840   345  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 841   346  history >nice-64.history
 842   347  fg
 843   348  fg
 844   349  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 845   350  bzr status
 846   351  history >nice-64.history
 847   352  bzr ci -m 'stopping point for 64'
 848   353  bzr status
 849   354  bzr status
 850   355  cd things/moebius2
 851   356  bzr status
 852   357  bzr diff
 853   358  bzr ci -m 'adjusted costs for 64'
 854   359  top
 855   360  top
 856   361  top
 857   362  cd things/moebius2/
 858   363  ./interpolate-125 -aa best-64.CFM -ostart-1256.cfm
 859   364  ./interpolate-125 -aa best-64.CFM -ostart-125.cfm
 860   365  rm ./start-1256.cfm
 861   366  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 862   367  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 863   368  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 864   369  cp start-125.cfm wip-125.cfm
 865   370  cp start-125.cfm wip-125.cfm
 866   371  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 867   372  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 868   373  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 869   374  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 870   375  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 871   376  ls -al minimise-125
 872   377  date
 873   378  lsss energy.c
 874   379  less energy.c
 875   380  make minimise-125
 876   381  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 877   382  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 878   383  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 879   384  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 880   385  ls
 881   386  ls *hist8
 882   387  ls *hist*
 883   388  history >wip-125.history
 884   389  bzr status
 885   390  bzr diff |les
 886   391  bzr diff |less
 887   392  bzr ci -m 'attempts to fix 125; really need to combine edge length variation and bending costs'
 888   393  bzr update
 889   394  ls ../
 890   395  bzr pull ../moebius2-from-liberator
 891   396  bzr merge ../moebius2-from-liberator
 892   397  bzr status
 893   398  bzr diff
 894   399  bzr ci -m merge
 895   400  bzr push
 896   401  bzr pull ../moebius2-from-liberator
 897   402  bzr merge ../moebius2-from-liberator
 898   403  bzr status
 899   404  bzr ci -m merge
 900   405  bzr status
 901   406  bzr pull ../moebius2-from-liberator
 902   407  cd things/moebius2
 903   408  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 904   409  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 905   410  ./interpolate-125 -aa best-64.CFM -ostart-125.cfm
 906   411  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 907   412  sync
 908   413  cd things/moebius2
 909   414  pwd
 910   415  bzr pull ../moebius2-from-liberator
 911   416  cat new-costs.history
 912   417  cp start-64.cfm wip-64.cfm
 913   418  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 914   419  cp wip-64.cfm best-64.CFM
 915   420  ./interpolate-125 -aa best-64.CFM -ostart-125.cfm
 916   421  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 917   422  cp start-125.cfm wip-125.cfm
 918   423  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 919   424  ./minimise-125 wip-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 920   425  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 921   426  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 922   427  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 923   428  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 924   429  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 925   430  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 926   431  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 927   432  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 928   433  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 929   434  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 930   435  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 931   436  ./interpolate-125 -aa best-64.CFM -ostart-125.cfm
 932   437  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 933   438  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 934   439  ./interpolate-125 -aa wip-64.cfm -ostart-125.cfm
 935   440  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 936   441  bzr status
 937   442  bzr diff
 938   443  bzr diff Makefile
 939   444  bzr ci -m 'build more stuff' Makefile
 940   445  bzr stauts
 941   446  bzr status
 942   447  bzr ci -m 'wip energy functions'
 943   448  bzr pull ../moebius2-from-liberator/
 944   449  bzr status
 945   450  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 946   451  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 947   452  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 948   453  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 949   454  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 950   455  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 951   456  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 952   457  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 953   458  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM 2>&1 |less
 954   459  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM 2>&1 |less
 955   460  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM 2>&1 |less
 956   461  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 957   462  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 958   463  bzr ci -m 'before abandon this version of rim twist which is nonsense'
 959   464  bzr ci -m 'before abandon this version of rim twist which is nonsense'
 960   465  bzr uncommit
 961   466  bzr status
 962   467  bzr log |less
 963   468  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 964   469  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 965   470  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 966   471  ./interpolate-125 -aa best-64.CFM -ostart-125.cfm
 967   472  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 968   473  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 969   474  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 970   475  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 971   476  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 972   477  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 973   478  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 974   479  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 975   480  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 976   481  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 977   482  bzr status
 978   483  bzr ci -m 'wip before increase power of bendings'
 979   484  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 980   485  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 981   486  bzr status
 982   487  bzr diff
 983   488  bzr ci -m 'changed powers on vertex displacements  -- tweaked parameters for XBITS==5'
 984   489  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 985   490  ./minimise-64 start-64.cfm -iwip-64.cfm -obest-64.CFM
 986   491  bzr status
 987   492  history >nice-64.history
 988   493  mv nice-64.history  nice-64-125.history
 989   494  bzr add nice-64-125.history
 990   495  bzr ci -m 'fixed XBITS==4'
 991   496  screen
 992   497  ./interpolate-125 -aa best-64.CFM -ostart-125.cfm
 993   498  cd things/moebius2
 994   499  ./minimise-125 start-125.cfm -iwip-125.cfm -obest-125.CFM
 995   500  bzr diff |less
 996   501  bzr ci -m 'scale 125 seems to work ish although could be more bowl-like'
 997   502  make -j4
 998   503  make -j4 minimise-246
 999   504  cat nice-64-125.history
1000   505  history >>nice-64-125.history